目前，煤焦化公司设置9个职能部门、4个直属中心，6家直属单位，19个生产厂。下设国能巴彦淖尔能源有限责任公司（属中国神华控股，位于巴彦淖尔市金泉加工园区，有洗煤厂、焦化厂、甲醇厂、水务公司、港务公司等5家生产单位）、国能蒙西煤化股份有限公司（位于鄂尔多斯市蒙西工业园区，有棋盘井煤矿、棋盘井煤矿东区、棋盘井洗煤厂、焦化一厂、焦化二厂、甲醇厂、华瑞公司等7家生产单位）、西来峰分公司（位于乌海市海南区西来峰工业园区，有焦化厂、甲醇厂、焦油厂、硝铵公司、发电厂、天信公司、兴荣洗煤厂等7家生产单位）、铁路公司、巴图塔洗配煤公司、驰恒监管区项目部。

煤焦化公司涉及煤炭、煤化工、电力、铁路、口岸仓储、供水等六大业务板块，生产能力为420万吨/年原煤、910万吨/年洗煤、610万吨/年焦炭、52万吨/年甲醇、18万吨/年硝铵、30万吨/年焦油加工、8万吨/年粗苯加工，仓储能力1500万吨/年，火电机组为2×200MW，专用铁路和铁路专运线计118公里。主要产品有：Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ级冶金焦、混煤、甲醇、硫铵、硫磺、煤沥青、工业萘、轻油、蒽油、甲苯、二甲苯、非芳烃、C8、硝铵等20余种。截止2021年10月底，公司资产总额201.89亿元，员工总数5468人